MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Strawberry lethal yellows phytoplasma (CPA) str. NZSb11

Total Repeats: 32631

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021236	ATT	2	6	8	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675885
2	NC_021236	GAA	2	6	28	33	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675885
3	NC_021236	AGA	2	6	39	44	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675885
4	NC_021236	GAA	2	6	112	117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675885
5	NC_021236	A	9	9	116	124	100 %	0 %	0 %	0 %	501675885
6	NC_021236	TTA	2	6	125	130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675885
7	NC_021236	AT	3	6	163	168	50 %	50 %	0 %	0 %	501675885
8	NC_021236	A	7	7	181	187	100 %	0 %	0 %	0 %	501675885
9	NC_021236	AAT	2	6	195	200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501675885
10	NC_021236	AAAAG	2	10	208	217	80 %	0 %	20 %	0 %	501675885
11	NC_021236	ATTGAA	2	12	223	234	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	501675885
12	NC_021236	ATT	2	6	235	240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675885
13	NC_021236	A	7	7	274	280	100 %	0 %	0 %	0 %	501675885
14	NC_021236	AAATT	2	10	308	317	60 %	40 %	0 %	0 %	501675885
15	NC_021236	A	6	6	410	415	100 %	0 %	0 %	0 %	501675885
16	NC_021236	AGA	3	9	420	428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675885
17	NC_021236	AC	3	6	481	486	50 %	0 %	0 %	50 %	501675885
18	NC_021236	A	10	10	518	527	100 %	0 %	0 %	0 %	501675885
19	NC_021236	A	6	6	529	534	100 %	0 %	0 %	0 %	501675885
20	NC_021236	GAA	2	6	565	570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675885
21	NC_021236	CAAT	2	8	576	583	50 %	25 %	0 %	25 %	501675885
22	NC_021236	TGA	2	6	645	650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675885
23	NC_021236	T	6	6	691	696	0 %	100 %	0 %	0 %	501675885
24	NC_021236	TTTA	2	8	713	720	25 %	75 %	0 %	0 %	501675885
25	NC_021236	ATT	2	6	736	741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675885
26	NC_021236	A	6	6	768	773	100 %	0 %	0 %	0 %	501675885
27	NC_021236	TAT	2	6	774	779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675885
28	NC_021236	AGG	2	6	804	809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	501675885
29	NC_021236	ACC	2	6	842	847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501675885
30	NC_021236	A	6	6	861	866	100 %	0 %	0 %	0 %	501675885
31	NC_021236	AAC	2	6	889	894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501675885
32	NC_021236	AAG	2	6	911	916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675885
33	NC_021236	ATA	2	6	947	952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501675885
34	NC_021236	ATT	2	6	981	986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675885
35	NC_021236	AATT	2	8	1014	1021	50 %	50 %	0 %	0 %	501675885
36	NC_021236	TTAA	2	8	1051	1058	50 %	50 %	0 %	0 %	501675885
37	NC_021236	A	9	9	1063	1071	100 %	0 %	0 %	0 %	501675885
38	NC_021236	A	6	6	1097	1102	100 %	0 %	0 %	0 %	501675885
39	NC_021236	TAGT	2	8	1112	1119	25 %	50 %	25 %	0 %	501675885
40	NC_021236	T	6	6	1123	1128	0 %	100 %	0 %	0 %	501675885
41	NC_021236	A	9	9	1156	1164	100 %	0 %	0 %	0 %	501675885
42	NC_021236	ATT	2	6	1237	1242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675885
43	NC_021236	T	7	7	1248	1254	0 %	100 %	0 %	0 %	501675885
44	NC_021236	A	6	6	1289	1294	100 %	0 %	0 %	0 %	501675885
45	NC_021236	A	8	8	1297	1304	100 %	0 %	0 %	0 %	501675885
46	NC_021236	A	7	7	1326	1332	100 %	0 %	0 %	0 %	501675885
47	NC_021236	A	6	6	1352	1357	100 %	0 %	0 %	0 %	501675885
48	NC_021236	AAT	2	6	1360	1365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501675885
49	NC_021236	A	7	7	1382	1388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021236	AGGA	2	8	1396	1403	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021236	AAT	2	6	1404	1409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021236	TAA	2	6	1432	1437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501675886
53	NC_021236	T	7	7	1443	1449	0 %	100 %	0 %	0 %	501675886
54	NC_021236	AAC	2	6	1452	1457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501675886
55	NC_021236	AT	3	6	1466	1471	50 %	50 %	0 %	0 %	501675886
56	NC_021236	A	8	8	1529	1536	100 %	0 %	0 %	0 %	501675886
57	NC_021236	AAG	2	6	1614	1619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675886
58	NC_021236	A	7	7	1661	1667	100 %	0 %	0 %	0 %	501675886
59	NC_021236	TCAA	2	8	1679	1686	50 %	25 %	0 %	25 %	501675886
60	NC_021236	T	6	6	1708	1713	0 %	100 %	0 %	0 %	501675886
61	NC_021236	AAATTA	2	12	1742	1753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501675886
62	NC_021236	T	8	8	1784	1791	0 %	100 %	0 %	0 %	501675886
63	NC_021236	A	8	8	1794	1801	100 %	0 %	0 %	0 %	501675886
64	NC_021236	T	6	6	1805	1810	0 %	100 %	0 %	0 %	501675886
65	NC_021236	TCT	2	6	1823	1828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675886
66	NC_021236	A	7	7	1832	1838	100 %	0 %	0 %	0 %	501675886
67	NC_021236	AAG	2	6	1845	1850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675886
68	NC_021236	A	6	6	1875	1880	100 %	0 %	0 %	0 %	501675886
69	NC_021236	TCTAA	2	10	1898	1907	40 %	40 %	0 %	20 %	501675886
70	NC_021236	A	7	7	1914	1920	100 %	0 %	0 %	0 %	501675886
71	NC_021236	A	7	7	1964	1970	100 %	0 %	0 %	0 %	501675886
72	NC_021236	AATT	2	8	2031	2038	50 %	50 %	0 %	0 %	501675886
73	NC_021236	GAT	2	6	2084	2089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675886
74	NC_021236	A	7	7	2090	2096	100 %	0 %	0 %	0 %	501675886
75	NC_021236	T	7	7	2097	2103	0 %	100 %	0 %	0 %	501675886
76	NC_021236	GGAA	2	8	2140	2147	50 %	0 %	50 %	0 %	501675886
77	NC_021236	AATTT	2	10	2166	2175	40 %	60 %	0 %	0 %	501675886
78	NC_021236	A	6	6	2176	2181	100 %	0 %	0 %	0 %	501675886
79	NC_021236	TGT	2	6	2191	2196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501675886
80	NC_021236	TAAA	2	8	2202	2209	75 %	25 %	0 %	0 %	501675886
81	NC_021236	GAT	2	6	2210	2215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675886
82	NC_021236	AGAA	2	8	2230	2237	75 %	0 %	25 %	0 %	501675886
83	NC_021236	T	7	7	2246	2252	0 %	100 %	0 %	0 %	501675886
84	NC_021236	AGA	2	6	2257	2262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675886
85	NC_021236	TAAA	2	8	2265	2272	75 %	25 %	0 %	0 %	501675886
86	NC_021236	TTGTT	2	10	2277	2286	0 %	80 %	20 %	0 %	501675886
87	NC_021236	A	6	6	2301	2306	100 %	0 %	0 %	0 %	501675886
88	NC_021236	A	6	6	2352	2357	100 %	0 %	0 %	0 %	501675886
89	NC_021236	CTT	2	6	2439	2444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675886
90	NC_021236	T	6	6	2454	2459	0 %	100 %	0 %	0 %	501675886
91	NC_021236	TAC	2	6	2491	2496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675886
92	NC_021236	AGA	3	9	2500	2508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675886
93	NC_021236	AGTTC	2	10	2510	2519	20 %	40 %	20 %	20 %	501675886
94	NC_021236	AGAA	2	8	2538	2545	75 %	0 %	25 %	0 %	501675886
95	NC_021236	T	6	6	2555	2560	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021236	T	6	6	2565	2570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021236	T	7	7	2578	2584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021236	A	6	6	2595	2600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021236	CTG	2	6	2612	2617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_021236	T	6	6	2662	2667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021236	T	8	8	2693	2700	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021236	T	7	7	2705	2711	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021236	T	7	7	2714	2720	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021236	T	6	6	2734	2739	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021236	TAAA	2	8	2756	2763	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021236	T	6	6	2767	2772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021236	ATTT	2	8	2802	2809	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021236	T	7	7	2807	2813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021236	AAT	2	6	2814	2819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021236	A	7	7	2822	2828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021236	T	6	6	2839	2844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021236	TTA	2	6	2852	2857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021236	AG	3	6	2870	2875	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021236	GAA	2	6	2885	2890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021236	TAA	2	6	2892	2897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021236	ATA	2	6	2938	2943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021236	A	7	7	2943	2949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021236	T	7	7	2967	2973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021236	AT	3	6	2982	2987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021236	ATT	2	6	2992	2997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021236	T	6	6	3002	3007	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021236	A	7	7	3031	3037	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021236	AG	3	6	3047	3052	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021236	AAC	2	6	3055	3060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_021236	GA	3	6	3107	3112	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021236	GAT	2	6	3126	3131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021236	TTA	2	6	3196	3201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021236	ATTA	2	8	3214	3221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021236	A	7	7	3247	3253	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021236	ACA	2	6	3274	3279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_021236	A	6	6	3284	3289	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021236	TAA	2	6	3291	3296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021236	A	8	8	3331	3338	100 %	0 %	0 %	0 %	501675887
134	NC_021236	A	8	8	3341	3348	100 %	0 %	0 %	0 %	501675887
135	NC_021236	AT	3	6	3372	3377	50 %	50 %	0 %	0 %	501675887
136	NC_021236	AAC	2	6	3383	3388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501675887
137	NC_021236	ATT	2	6	3395	3400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675887
138	NC_021236	ATG	2	6	3404	3409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675887
139	NC_021236	A	8	8	3433	3440	100 %	0 %	0 %	0 %	501675887
140	NC_021236	T	8	8	3484	3491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021236	A	6	6	3497	3502	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021236	T	6	6	3514	3519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021236	ATA	2	6	3546	3551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021236	TAT	2	6	3558	3563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021236	CGG	2	6	3608	3613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_021236	GCC	2	6	3651	3656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_021236	AAT	2	6	3659	3664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021236	A	7	7	3667	3673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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150	NC_021236	A	7	7	3773	3779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021236	ATG	2	6	3886	3891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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434	NC_021236	AT	3	6	12044	12049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
435	NC_021236	ATG	2	6	12064	12069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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437	NC_021236	ATC	2	6	12166	12171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
438	NC_021236	AAT	2	6	12203	12208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
439	NC_021236	TTC	2	6	12214	12219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
440	NC_021236	CTT	2	6	12227	12232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
441	NC_021236	AAATT	3	15	12239	12253	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
442	NC_021236	A	7	7	12263	12269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
443	NC_021236	AT	3	6	12272	12277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
444	NC_021236	TCA	2	6	12285	12290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
445	NC_021236	GAG	2	6	12295	12300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
446	NC_021236	TTC	2	6	12326	12331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
447	NC_021236	TGA	2	6	12417	12422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
448	NC_021236	T	6	6	12434	12439	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
449	NC_021236	T	7	7	12442	12448	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
450	NC_021236	TTG	2	6	12470	12475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
451	NC_021236	ACC	2	6	12494	12499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
452	NC_021236	A	6	6	12537	12542	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
453	NC_021236	T	6	6	12556	12561	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
454	NC_021236	ACA	2	6	12577	12582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
455	NC_021236	AT	3	6	12593	12598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
456	NC_021236	TAAA	2	8	12608	12615	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
457	NC_021236	GTT	2	6	12671	12676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
458	NC_021236	T	6	6	12736	12741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
459	NC_021236	TTG	2	6	12770	12775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
460	NC_021236	TCA	2	6	12789	12794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
461	NC_021236	ATT	2	6	12795	12800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
462	NC_021236	TAAA	2	8	12847	12854	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
463	NC_021236	TTC	2	6	12892	12897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
464	NC_021236	ATTA	2	8	12941	12948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
465	NC_021236	T	9	9	12973	12981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
466	NC_021236	CTT	2	6	12987	12992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
467	NC_021236	A	8	8	13010	13017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
468	NC_021236	T	6	6	13022	13027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
469	NC_021236	A	6	6	13031	13036	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
470	NC_021236	TCA	2	6	13038	13043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
471	NC_021236	CTATT	2	10	13045	13054	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
472	NC_021236	TA	3	6	13061	13066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
473	NC_021236	T	7	7	13068	13074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
474	NC_021236	T	6	6	13077	13082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
475	NC_021236	A	7	7	13090	13096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
476	NC_021236	ATT	2	6	13106	13111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
477	NC_021236	TAT	2	6	13118	13123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
478	NC_021236	TATAA	2	10	13126	13135	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
479	NC_021236	GTA	2	6	13136	13141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
480	NC_021236	A	7	7	13179	13185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
481	NC_021236	T	6	6	13192	13197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
482	NC_021236	AAT	2	6	13201	13206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501675893
483	NC_021236	TTTC	2	8	13241	13248	0 %	75 %	0 %	25 %	501675893
484	NC_021236	AGG	2	6	13257	13262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	501675893
485	NC_021236	ATGT	2	8	13285	13292	25 %	50 %	25 %	0 %	501675893
486	NC_021236	TTG	2	6	13319	13324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501675893
487	NC_021236	TTTTTC	2	12	13332	13343	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	501675893
488	NC_021236	T	6	6	13350	13355	0 %	100 %	0 %	0 %	501675893
489	NC_021236	AATT	2	8	13362	13369	50 %	50 %	0 %	0 %	501675893
490	NC_021236	TCAC	2	8	13430	13437	25 %	25 %	0 %	50 %	501675893
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492	NC_021236	TTAT	2	8	13467	13474	25 %	75 %	0 %	0 %	501675893
493	NC_021236	A	7	7	13476	13482	100 %	0 %	0 %	0 %	501675893
494	NC_021236	TTA	2	6	13525	13530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675893
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